Het weren van ongedierte is de belangrijkste preventieve maatregel die de CBL-code voorschrijft. Daarnaast dient de supermarkt een programma te hebben voor ongediertebestrijding. Dit mag hij zelf opstellen of door een gespecialiseerd bedrijf laten uitvoeren. Er moet èèn persoon verantwoordelijk zijn voor de ongediertebestrijding in de supermarkt en dat betekent dat je het niet blind kunt over laten aan een extern bedrijf. Tijdens de inspecties van het zelfcontrolesysteem stelt HH regelmatig vast dat ongediertebestrijdingsbureaus adviezen geven via hun registratiesysteem, waar geen follow-up op komt. Dit wordt aangemerkt als een tekort in de beheersing van het HACCP-systeem. Anderzijds wordt tijdens de inspectie vastgesteld dat plattegronden van de te plaatsen lokaasdozen ontbreken of onjuist zijn door verdwenen lokaasdozen. Hier ligt dus een taak voor de supermarkt om regelmatig te controleren.